Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw4Q9JMJ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw4Q9JMJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw4Q9JMJ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw4Q9JMJ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxw4Q9JMJ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxw4Q9JMJ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms