Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SacsQ9JLC8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SacsQ9JLC8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms