Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms