Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lmbr1Q9JIT0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1Q9JIT0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms