Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp1r3fQ9JIG4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms