Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod3Q9JHJ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Tmod3Q9JHJ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod3Q9JHJ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Tmod3Q9JHJ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod3Q9JHJ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms