Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn1Q9EPL2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn1Q9EPL2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms