Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc107Q9DCC3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc107Q9DCC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms