Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fundc1Q9DB70 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms