Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmbim4Q9DA39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms