Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin37Q9D8N6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms