Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AY761184Q9D848 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AY761184Q9D848 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms