Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ribc2Q9D4Q1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ribc2Q9D4Q1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms