Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efhd1Q9D4J1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efhd1Q9D4J1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms