Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eaf1Q9D4C5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eaf1Q9D4C5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Eaf1Q9D4C5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms