Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2lQ9D478 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2lQ9D478 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms