Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Katnal2Q9D3R6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Katnal2Q9D3R6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms