Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy3Q9D394 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy3Q9D394 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms