Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms