Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1bQ9D1G1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms