Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrto4Q9D0I8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrto4Q9D0I8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms