Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Polr3eQ9CZT4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Polr3eQ9CZT4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Polr3eQ9CZT4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms