Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pin4Q9CWW6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms