Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx28Q9CWT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms