Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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