Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn3Q9CVD2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms