Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CR55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CR55 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CR55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CR55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CR55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CR55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CR55 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CR55 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CR55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CR55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CR55 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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