Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd9Q9CR00 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmd9Q9CR00 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms