Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms