Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CQ90 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms