Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Commd4Q9CQ02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Commd4Q9CQ02 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms