Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska1Q9CPV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ska1Q9CPV1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms