Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sike1Q9CPR7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sike1Q9CPR7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms