Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt88Q9CPR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt88Q9CPR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms