Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup155Q99P88 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup155Q99P88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup155Q99P88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms