Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd1Q99MV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd1Q99MV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms