Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms