Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nus1Q99LJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms