Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsl24d1Q99L28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsl24d1Q99L28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms