Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TriobpQ99KW3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms