Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PpifQ99KR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms