Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ciao1Q99KN2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ciao1Q99KN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ciao1Q99KN2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms