Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed9Q99KF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed9Q99KF1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms