Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Clip1Q922J3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms