Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Setd3Q91WC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Setd3Q91WC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms