Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sfxn3Q91V61 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms