Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrkQ8VDU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrkQ8VDU5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms