Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Ubxn4Q8VCH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ubxn4Q8VCH8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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