Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RfxapQ8VCG9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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