Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms