Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms